Stosownie do postanowień art. 19 ww. ustawy, podatnik ma prawo do obniżenia kwoty podatku należnego o kwotę podatku naliczonego przy nabyciu towarów i usług, związanych ze sprzedażą opodatkowaną. Kwotę podatku naliczonego stanowi suma kwot podatku określonych w fakturach nabycie towarów i usług, z uwzględnieniem rabatów określonych w art. 15 ust. 2, a w przypadku importu – suma kwot podatku wynikająca z dokumentu celnego.
Natomiast art. 11h ustawy o podatku od towarów i usług stanowi, że:

„W przypadku, gdy w wyniku weryfikacji zgłoszenia celnego okaże się, że kwota podatków została nadpłacona, podatnikowi nie przysługuje zwrot nadpłaconych podatków, jeżeli kwota nadpłaconego w imporcie:

1) podatku od towarów i usług – pomniejszyła kwotę podatku należnego
2) podatku akcyzowego – pomniejszyła kwotę podatku akcyzowego lub powiększyła kwotę podatku naliczonego, o którym mowa w art. 19 ust. 1 i 2.”

Z zestawienia ww. przepisów wynika jednoznacznie, że podatnik:

1) ma prawo do obniżenia podatku należnego o podatek naliczony wynikający z importu towarów (przy spełnieniu innych warunków określonych przepisami prawa),
2) nie ma obowiązku dokonania korekt podatku naliczonego w związku z decyzją organu celnego korygującą wysokość tego podatku.

Podatnik skorzystał z uprawnienia polegającego na możliwości pomniejszenia podatku należnego o kwotę podatku naliczonego wynikającego z importu materiałów służących do produkcji wyrobów opodatkowanych, zatem zgodnie z literalnym brzmieniem cytowanego wyżej artykułu Spółce nie przysługuje prawo do zwrotu nadpłaconego podatku VAT.
W związku z powyższym stanowisko Podatnika należy uznać za uzasadnione.