Prowadzący działalność gospodarczą Podatnik wraz z żoną na zasadzie wspólnoty małżeńskiej nabyli w 1997 r. działkę budowlaną, na której w latach 1997-98 wybudowali budynek mieszkalno-usługowy. Budowa jednak zakończyła się na etapie stanu zamkniętego nie oddanego do użytku, nie dokonano odbioru budynku, więc nie został on dotąd zasiedlony ani zamieszkany. Nakłady inwestycyjne związane z budową części mieszkalnej odliczane były w ramach tzw. ulgi budowlanej, a od nakładów inwestycyjnych związanych z prowadzoną działalnością gospodarczą (nakładów na budowę części usługowej) odliczany był podatek VAT. Ponoszone nakłady inwestycyjne związane z działalnością gospodarczą nie były rozliczane ulgą inwestycyjną ani też nie były amortyzowane.

Ad 1) W myśl art. 146 ust. 1 pkt 2 lit. b ustawy z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług (Dz. U. Nr 54, poz. 535) w okresie do dnia 31 grudnia 2007 r. stosuje się stawkę w wysokości 7% w odniesieniu do obiektów budownictwa mieszkaniowego lub ich części, z wyłączeniem lokali użytkowych. W związku z tym do sprzedaży części mieszkalnej budynku należy zastosować stawkę podatku VAT w wysokości 7%, a sprzedaż części usługowej podlegać będzie zgodnie z art. 41 ust. 1 tejże ustawy opodatkowaniu stawką 22%. Dodać należy, że w przypadku dostawy budynków lub budowli trwale związanych z gruntem albo części takich budynków lub budowli z podstawy opodatkowania nie wyodrębnia się wartości gruntu (art. 29 ust. 5 w/w ustawy o VAT), która w związku z tym stanowi element podstawy opodatkowania tych nieruchomości – według stawek dla nich właściwych.

Ad 2) W opisanej sytuacji sprzedaż nie stanowi źródła przychodów podlegających zryczałtowanemu podatkowi dochodowemu od osób fizycznych. Ustawa z dnia 26 lipca 1991 r. o podatku dochodowym od osób fizycznych (j.t. Dz. U. z 2000 r. Nr 14, poz. 176 ze zm.) wśród źródeł przychodu podlegających podatkowi dochodowemu wymienia w art. 10 ust. 1 pkt 8 przychód ze sprzedaży nieruchomości lub ich części oraz udziału w nieruchomości, jeżeli odpłatne zbycie nastąpiło przed upływem pięciu lat, licząc od końca roku kalendarzowego, w którym nastąpiło nabycie lub wybudowanie. Ponieważ prawo podatkowe nie zawiera definicji nieruchomości należy odnieść się do przepisów prawa cywilnego, z którego treści wynika, iż budynek trwale związany z gruntem jako składowa część gruntu nie może być przedmiotem odrębnej własności. Wobec czego zbycie gruntu, jak i znajdującego się na nim budynku, trwale z nim związanego stanowi sprzedaż nieruchomości. Bieg pięcioletniego terminu określonego we wspomnianym art. 10 ust. 1 pkt 8 ustawy o VAT nie może być liczony odrębnie dla nabycia własności gruntu oraz dla wybudowanego na tym gruncie budynku – w związku z powyższym uzyskany przychód w tej sytuacji nie podlega opodatkowaniu. Należy podkreślić, iż wydatki ponoszone przez Podatnika na wybudowanie części usługowej nie powinny stanowić kosztów uzyskania przychodów (art. 23 ust. 1 ustawy o pdof) prowadzonej przez niego działalności.

Ad 3) Według art. 106 ust. 1 w/w ustawy podatnicy, o których mowa w art. 15 (a więc m.in. osoby fizyczne wykonujące działalność gospodarczą) są obowiązani wystawić fakturę stwierdzającą w szczególności dokonanie sprzedaży.