W przedstawionym przez Pana stanie faktycznym przepisy prawa podatkowego – ustawy z dnia 26.07.1991r. o podatku dochodowym od osób fizycznych (Dz. U. z 2000r. Nr 14, poz. 176 ze zm.) - dotyczące podatku dochodowego od sprzedaży nieruchomości, w zależności od stasusu poszczególnych części tej nieruchomości, stosuje się następująco:

I. sprzedaż pawilonu handlowego dobudowanego w 1995 roku oraz przyległego budynku gospodarczego zakupionego w 1998r. przeznaczonych na cele działalności gospodarczej podlega opodatkowaniu na podstawie art. 14 ust. 2 pkt 12 ustawy, który stanowi, że:

„przychodem z działalności gospodarczej są również przychody z odpłatnego zbycia wykorzystywanych na potrzeby związane z działalnością gospodarczą oraz przy prowadzeniu działów specjalnych produkcji rolnej składników majątku będących:

a) środkami trwałymi,
b) składnikami majątku, o których mowa w art. 22d ust. 1, z wyłączeniem składników majątku, których wartość początkowa, ustalona zgodnie z art. 22g, nie przekracza 1500 zł.
c) wartościami niematerialnymi i prawnymi

- ujętych w ewidencji środków trwałych oraz wartości niematerialnych i prawnych, w tym także przychody z odpłatnego zbycia składników majątku wymienionych w lit. b), spółdzielczego własnościowego prawa do lokalu użytkowego lub udziału w takim prawie nieujętych w ewidencji środków trwałych oraz wartości niematerialnych i prawnych, z zastrzeżeniem ust. 2c; przy określaniu wysokości przychodów przepisy ust. 1 i art. 19 stosuje się odpowiednio”.

Dochód z odpłatnego zbycia składników majątku, o których mowa w art. 14 ust. 2 pkt 1 ustawy określa się zgodnie z art. 24 ust. 2 ustawy, stanowiącym:

„dochodem z odpłatnego zbycia składników majątku, o których mowa w art. 14 ust. 2 pkt 1, wykorzystywanych na potrzeby działalności gospodarczej lub działów specjalnych produkcji rolnej, jest przychód z odpłatnego zbycia składników majątku, o których mowa w art. 14 ust. 2 pkt 1 lit. b), a w pozostałych przypadkach dochodem lub stratą jest różnica między przychodem z odpłatnego zbycia a:

1) wartością początkową wykazaną w ewidencji środków trwałych oraz wartości niematerialnych i prawnych, z zastrzeżeniem pkt 2, powiększona o sumę odpisów amortyzacyjnych, o których mowa w art. 22h ust. 1 pkt 1, dokonanych od tych środków i wartości lub
2) wartością wynikającą z dokumentu stwierdzającego nabycie spółdzielczego własnościowego prawa do lokalu użytkowego lub udziału w takim prawie, którego wartość początkową dla celów dokonywania odpisów amortyzacyjnych ustalono zgodnie z art. 22g ust. 10, powiększona o sumę odpisów amortyzacyjnych, o których mowa w art. 22h ust. 1 pkt 1 dokonanych od tego prawa lub udziału w takim prawie.”

II. Sprzedaż budynku mieszkalnego stanowi źródło przychodów na podstawie przepisu art. 10 ust. 1 pkt 8 ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych. Podatek ze sprzedaży ustala się zgodnie z art. 28 ustawy. Z przedstawionego stanu faktycznego wynika, że nabycie budynku mieszkalnego nastąpiło w roku 1988. Sprzedaż nastąpi po upływie pięciu lat, licząc od końca roku kalendarzowego, w którym nastąpiło nabycie, zatem powołane przepisy nie mają zastosowania.

III. Sprzedaż części budynku mieszkalnego wykorzystywanej w związku z prowadzoną działalnością gospodarczą została wyłączona z przychodów, o których mowa w art. 14 ust. 2 pkt 1 przez art. 14 ust. 2c ustawy i stanowi źródło przychodów zgodnie z art. 10 ust. 3 ustawy. Przepis art. 14 ust. 2c mówi, że „do przychodów, o których mowa w ust. 2 pkt 1, nie zalicza się przychodów z odpłatnego zbycia wykorzystywanych na potrzeby związane z działalnością gospodarczą oraz przy prowadzeniu działów specjalnych produkcji rolnej: budynku mieszkalnego, jego części... .Przepis art. 28 stosuje się odpowiednio.” W przedstawionym przez Pana stanie faktycznym podano, że sprzedaż nastąpi po upływie pięciu lat, licząc od końca roku kalendarzowego, w którym nastąpiło nabycie budynku, w związku z tym nie ustala się podatku od przychodu z odpłatnego zbycia części budynku mieszkalnego przeznaczonego na działalność gospodarczą.