Zgodnie z § 8 ust.1 pkt.6 rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 27 kwietnia 2004r. w sprawie wykonania niektórych przepisów ustawy o podatku od towarów i usług (Dz.U. z 2004r. Nr 97, poz.970) zwalnia się od podatku wkłady niepieniężne (aporty) wnoszone do spółek prawa handlowego i cywilnego.

Jednakże w przypadku aportu całego przedsiębiorstwa zastosowanie znajduje art.6 pkt.1 ustawy z dnia 11 marca 2004r. o podatku od towarów i usług (Dz.U. z 2004r. Nr 54, poz. 535), w myśl którego przepisów ustawy nie stosuje się do transakcji zbycia przedsiębiorstwa lub zakładu (oddziału) samodzielnie sporządzającego bilans.Zatem w przypadku zbycia przedsiębiorstwa w formie aportu – czynność ta nie podlega opodatkowaniu podatkiem VAT.

Zgodnie z art.91 ust.9 ustawy „w przypadku zbycia przedsiębiorstwa (...) korekta określona w ust. 1-8 jest dokonywana odpowiednio przez nabywcę przedsiębiorstwa (...)”. Biorąc pod uwagę wyżej cytowany art.91 ust.9 ustawy - zbycie przedsiębiorstwa (w formie aportu) nie skutkuje w sferze wcześniejszych odliczeń podatku dokonanych przez podatnika – zbywcę.

Czynność ta nakłada jednak na nabywcę – obowiązek dokonywania stosownych korekt w zakresie podatku naliczonego, który został częściowo odliczony przez zbywcę w oparciu o wyliczoną przez niego proporcję sprzedaży opodatkowanej do sprzedaży ogółem.Przyjmujący aport, jako beneficjent praw i obowiązków zbywcy, obowiązany jest również do dokonania korekty podatku naliczonego, w przypadku, gdy w trakcie prowadzonej działalności zmianie ulegnie przeznaczenie towaru, od którego podatek został odliczony lub nie odliczony w całości (w związku z art. 86 ust.1 ustawy).