W przedmiotowej sprawie opodatkowania zaliczek na poczet przyszłych transakcji będą miały zastosowanie przepisy art.19 ust.11, art.29 ust.1 i 2, art.106 ust. 3 i 4, art.111 ust.1 ustawy z dnia 11 marca 2004r. o podatku od towarów i usług ( Dz. U. Nr 54 poz. 535 ) oraz § 17 rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 27 kwietnia 2004r. w sprawie zwrotu podatku niektórym podatnikom , zaliczkowego zwrotu podatku, zasad wystawiania faktur, sposobu ich przechowywania oraz listy towarów i usług , do których nie mają zastosowania zwolnienia od podatku od towarów i usług ( Dz. U. Nr 97, poz. 971 ).Zgodnie z art. 19 ust. 11 cyt. ustawy o podatku od towarów i usług jeżeli przed wydaniem towaru lub wykonaniem usługi otrzymano część należności, w szczególności: przedpłatę , zaliczkę, zadatek, ratę, obowiązek podatkowy powstaje z chwilą jej otrzymania w tej części.W myśl art.29 ust.1 cyt. ustawy o podatku od towarów i usług podstawą opodatkowania jest obrót, z zastrzeżeniem ust. 2-22, art.30-32, art. 119 oraz art. 120 ust. 4. Obrotem jest kwota należna z tytułu sprzedaży , pomniejszona o kwotę należnego podatku. Kwota należna obejmuje całość świadczenia należnego od nabywcy. Obrotem jest także otrzymana dotacja, subwencja i inna dopłata o podobnym charakterze związana z dostawą lub świadczeniem.Zgodnie z art. 29 ust. 2 cyt. ustawy o podatku od towarów i usług w przypadku gdy pobrano zaliczki, zadatki, przedpłaty lub raty, obrotem jest również kwota otrzymanych zaliczek, zadatków, przedpłat lub rat, pomniejszona o przypadającą od nich kwotę podatku . Dotyczy to również otrzymanych zaliczek na dotacje, subwencje i na inne dopłaty o podobnym charakterze.W myśl art.106 ust. 3 cyt. ustawy o podatku od towarów i usług przepisy ust. 1 i 2 (dotyczące obowiązku wystawiania faktury ) stosuje się odpowiednio do części należności otrzymanych przed wydaniem towaru lub wykonaniem usługi. Zgodnie z art.106 ust. 4 cyt. ustawy o podatku od towarów i usług podatnicy , o których mowa w ust. 1-3, nie mają obowiązku wystawiania faktur, o których mowa w ust. 1 i 2, osobom fizycznym nieprowadzącym działalności gospodarczej. Jednakże na żądanie tych osób podatnicy są obowiązani do wystawienia faktury. W myśl art.111 ust. 1 cyt. ustawy o podatku od towarów i usług podatnicy dokonujący sprzedaży na rzecz osób fizycznych nieprowadzących działalności gospodarczej oraz osób fizycznych prowadzących działalność gospodarczą w formie indywidualnych gospodarstw rolnych są obowiązani prowadzić ewidencję obrotu i kwot podatku należnego przy zastosowaniu kas rejestrujących.Reasumując należy stwierdzić, iż w przedmiotowej sprawie obowiązkowi podatkowemu podlega przyjęcie zaliczki przed wydaniem towaru lub wykonaniem usługi. Pobrana zaliczka pomniejszona o przypadającą od niej kwotę podatku należnego stanowi u podatnika obrót.Jeżeli zaliczka została pobrana od osoby fizycznej nieprowadzącej działalności gospodarczej lub osoby fizycznej prowadzącej działalność gospodarczą w formie indywidualnego gospodarstwa rolnego podatnik nie ma obowiązku wystawienia faktury, jednakże na jej żądanie podatnik ma obowiązek wystawienia faktury.Pobranie zaliczki na poczet przyszłego wydania towaru lub wykonania usługi na rzecz osób fizycznych nieprowadzących działalności gospodarczej oraz osób fizycznych prowadzących działalność gospodarczą w formie indywidualnych gospodarstw rolnych podlega zaewidencjonowaniu przy zastosowaniu kas rejestrujących.Zasady wystawiania faktur w przypadku otrzymania zaliczki przed wydaniem towaru lub wykonaniem usługi szczegółowo określa § 17 cyt. rozporządzenia Ministra Finansów.Zgodnie z § 17 ust. 4 cyt. rozporządzenia Ministra Finansów jeżeli faktury , o których mowa w ust.1 i 2, nie obejmują całej ceny brutto, sprzedawca po wydaniu towaru lub wykonaniu usługi wystawia fakturę na zasadach określonych w § 12 i § 14-16, z tym że sumę wartości towarów ( usług ) pomniejsza się o wartość otrzymanych części należności, a kwotę podatku pomniejsza się o sumę kwot podatku wykazanego w fakturach dokumentujących pobranie części należności; taka faktura powinna zawierać również numery faktur wystawionych przed wydaniem towaru lub wykonaniem usługi.