Zgodnie z art. 160 ust. 3 ustawy z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług (Dz.U. Nr 54, poz. 535) osoba prawna, której zakłady (oddziały) rozliczały się jako odrębni podatnicy, wstępuje z dniem 1 maja 2004 r. we wszystkie przewidziane w przepisach prawa podatkowego prawa i obowiązki swego zakładu ( oddziału ), który przestał być wyodrębnionym podatnikiem- w zakresie, w jakim dotyczą podatku od towarów i usług.

Z przytoczonego przepisu wynika, że w zakresie podatku od towarów i usług sukcesji podlegają wszelkie prawa i wszelkie obowiązki, które ciążyły na zakładzie (oddziale) osoby prawnej posiadającym przed 1 maja 2004 r. status odrębnego podatnika VAT, a wynikają z przepisów prawa podatkowego.

W związku z powyższym należy stwierdzić, że działania polegające na wystawianiu faktur korygujących dotyczących faktur wystawionych przez Oddziały do 30.04.2004 r. oraz sporządzeniu korekt deklaracji złożonych przez Oddziały są prawidłowe.

Ponadto wskazać należy, że ustawodawca nie uregulował w przepisach przejściowych zasad dotyczących odliczenia podatku naliczonego w miesiącach następnych z faktur wystawionych do 30 kwietnia 2004 r. dotyczących dostaw energii elektrycznej, cieplnej, gazu przewodowego, usług telekomunikacyjnych.

Jednak biorąc pod uwagę istotę podatku od towarów i usług, tj. prawo do obniżenia kwoty podatku należnego o kwotę podatku naliczonego, uznać należy, że Strona może po 30.04.2004 r. dokonać odliczenia podatku naliczonego z faktur dokumentujących zakup energii elektrycznej, cieplnej, gazu przewodowego, usług telekomunikacyjnych oraz z duplikatów faktur wystawionych po 30.04.2004r., dotyczących faktur wystawionych na Oddziały .

Zasada rozliczenia nadwyżki podatku naliczonego nad należnym wykazanej w deklaracji VAT-7 za kwiecień 2004 r. do przeniesienia na następny okres rozliczeniowy została uregulowana w art. 162 ust.2 ustawy o podatku od towarów i usług. Przepis ten odnosi się do wszystkich podatników od towarów i usług. Ma on także zastosowanie do osób prawnych wstępujących w prawa zakładu ( oddziału). W myśl przepisu tego artykułu do nadwyżki podatku naliczonego nad należnym, o której mowa w art.21 ust.1 ustawy z dnia 8 stycznia 1993 r., wynikającej z ostatniej deklaracji podatkowej złożonej za okres przed dniem wejścia w życie ustawy stosuje się art.87.

Z cytowanego przepisu oraz przepisu art.160 ust.3 ustawy o podatku od towarów i usług wynika, że osoba prawna może wykazać w deklaracji VAT-7 za maj 2004 r. nadwyżkę podatku naliczonego wynikającą z deklaracji VAT-7 za kwiecień 2004r. wynikającą z deklaracji złożonej przez jej zakład (oddziały), które rozliczały się jako odrębni podatnicy.