Usługi weterynaryjne podlegają opodatkowaniu podatkiem od towarów i usług wg stawki 7% (poz. 152 zał. nr 3 do ustawy z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług (Dz. U. Nr 54, poz. 535 z 2004 r.).

Usługi badania zwierząt rzeźnych i mięsa wykonywane przez lekarzy weterynarii podlegają opodatkowaniu wg stawki 7% (§ 5 ust. 1 i poz. 17 zał. nr 1 do rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 27 kwietnia 2004 r. w sprawie wykonania niektórych przepisów ustawy o podatku od towarów i usług (Dz. U. Nr 97, poz. 970 z 2004 r.)

Sposób rozliczania pobieranych należności powinna określać umowa między świadczącymi usługi i Inspekcją Weterynaryjną. Jeżeli koszt dojazdu i wartość zużytych leków są tylko elementami kalkulacyjnymi opłaty (ceny) to podlegają opodatkowaniu wg stawki właściwej dla usługi (7%) , a w przypadku ich wyodrębnienia należy je opodatkować wg właściwych stawek dla dojazdu i sprzedaży leków.

Przepisy ustawy o Inspekcji Weterynaryjnej przewidują, że powiatowy lekarz weterynarii, w warunkach określonych w art.16 tej ustawy , może wyznaczyć na czas określony lekarzy weterynarii lub inne osoby posiadające odpowiednie kwalifikacje do wykonywania niektórych czynności pomocniczych, nie będących pracownikami Inspekcji Weterynaryjnej, do wykonywania określonych czynności. Wyznaczenie tych osób następuje w drodze decyzji administracyjnej powiatowego lekarza weterynarii określającej rodzaj i zakres czynności przekazanych do wykonania, a następnie poprzez zawarcie stosownej umowy.

Należy zauważyć, że stosownie do art.5 ust.3 ustawy o Inspekcji Weterynaryjnej, lekarze weterynarii wyznaczeni do wykonywania określonych czynności, wykonują powierzone czynności pod nadzorem i w imieniu organów Inspekcji Weterynaryjnej. Ponadto przychody osiągane przez lekarzy weterynarii wykonujących określone czynności na zlecenie i w imieniu Inspekcji Weterynaryjnej są kwalifikowane do przychodów, o których mowa w art.13 pkt 6 ustawy z dnia 26 lipca 1991r. o podatku dochodowym od osób fizycznych (Dz.U z 2000r. Nr 14, poz.176 ze zm.).

W myśl wskazanego przepisu przychodami z dzialalności wykonywanej osobiście są przychody osób, którym organ władzy lub administracji państwowej albo samorządowej, sąd lub prokurator, na podstawie właściwych przepisów zlecił wykonanie określonych czynności . Zgodnie natomiast z art.15 ust.3 pkt 3 ustawy z dnia 11 marca 2004r. o podatku od towarów i usług za wykonywaną samodzielnie działalność gospodarczą , o której mowa w ust.1 tej ustawy , nie uznaje sie czynności z tytułu których przychody zostały wymienione w art.13 pkt.2-8 ustawy z dnia 26 lipca 1991r. o podatku dochodowym od osób fizycznych, jeżeli z tytułu wykonania tych czynności osoby te są związane ze zlecającym wykonanie tych czynności prawnymi więzami tworzącymi stosunek prawny pomiędzy zlecającym wykonanie czynności i wykonującym zlecane czynności co do warunków wykonywania tych czynności, wynagrodzenia i odpowiedzialności zlecającego wykonanie tych czynności.

W związku z tym wykonanie czynności, o których mowa w art.16 ust.1 pkt 1 ustawy z dnia 29 stycznia 2004r. o Inspekcji Weterynaryjnej (Dz.U.Nr 33, poz.287) , zarówno przez Inspekcję Weterynaryjną, jak i wyznaczonych przez powiatowego lekarza weterynarii do wykonywania niektórych czynności pomocniczych lekarzy weterynarii lub inne osoby posiadające odpowiednie kwalifikacje - nie podlega opodatkowaniu podatkiem od towarów i usług.

Wobec powyższego usługi badania zwierząt rzeźnych i mięsa, wykonywane przez lekarzy weterynarii na warunkach, o których mowa powyżej , nie podlegają opodatkowaniu podatkiem od towarów i usług. Natomiast wykonywanie wskazanych usług"bez wyznaczenia" Powiatowego Lekarza Weterynarii podlega, jak już wskazano powyżej, opodatkowaniu 7% stawką podatku VAT.