Zgodnie z art. 29 ust. 1 ustawy z dnia 11 marca 2004r. o podatku od towarów i usług (Dz. U. Nr 54, poz. 535) „podstawą opodatkowania jest obrót...Obrotem jest także otrzymana dotacja, subwencja i inna dopłata o podobnym charakterze związana z dostawą lub świadczeniem usług”Z regulacji art. 29 ust. 1 ustawy o VAT wynika, że w sytuacji gdy podatnik – w związku z konkretną dostawą towarów lub świadczeniem usług – otrzymuje od innego podmiotu jakiekolwiek dofinansowanie (dotację, subwencję) stanowiące dopłatę do ceny towaru lub usługi – tego rodzaju dofinansowanie stanowi obok ceny, uzupełniający ją element podstawy opodatkowania z tytułu tej dostawy lub świadczenia. W związku z powyższym dopłaty do serów otrzymywane przez Spółdzielnię mają charakter dotacji związanych z dostawą towarów i określonych w cyt. art. 29 ust. 1 ustawy o VAT, więc podlegają opodatkowaniu podatkiem od towarów i usług według stawki obowiązującej dla towaru, którego te dotacje dotyczą.Na podstawie przepisu art. 41 ust. 4 cyt. ustawy o VAT stawka podatkowa w eksporcie towarów wynosi 0 %, dlatego również dla dotacji związanej z eksportem towarów stawka podatkowa będzie wynosiła 0 %.

Z przedstawionego stanu faktycznego wynika, iż podatnik otrzymuje dopłaty w ramach Wspólnej Polityki Rolnej Unii Europejskiej dotyczące wywozu produktów mleczarskich. Powyższe dopłaty są przekazywane Spółdzielni za pośrednictwem Agencji Rynku Rolnego po wyeksportowaniu poza Unię Europejską serów twardych na zasadach zawartych w Rozporządzeniu Komisji (WE) nr 800/1999 z dnia 15 kwietnia 1999 r. „ustanawiające wspólne szczegółowe zasady stosowania systemu refundacji wywozowych na produkty rolne” , Rozporządzeniu Komisji (WE) nr 174/1999 z dnia 26 stycznia 1999 r. „ustanawiające specjalne szczegółowe zasady stosowania rozporządzenia Rady (EWG) nr 804/68 w odniesieniu do pozwoleń na wywóz i refundacji wywozowych do mleka i przetworów mlecznych”.

Od 1 stycznia 2004 r. na mocy art. 17 ust. 1 pkt 36 ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych: „wolne od podatku są dopłaty bezpośrednie stosowane w ramach Wspólnej Polityki Rolnej Unii Europejskiej, otrzymane na podstawie odrębnych przepisów”.

W ramach regulacji handlu zagranicznego na rynku mleka Agencja Rynku Rolnego odpowiedzialna jest za: -wydawanie i rozliczenie pozwoleń na przywóz i wywóz,- wypłacanie refundacji wywozowych,- nakładanie kar administracyjnych.

Ceny produktów rolno-spożywczych na rynku wewnętrznym UE kształtują się na poziomie wyższym niż ceny światowe. Dlatego też w celu zapewnienia odpowiedniej konkurencyjności produktów rolno-spożywczych przeznaczonych na wywóz Unia Europejska stosuje refundacje wywozowe.

Refundacja wywozowa jest formą dopłaty, która pokrywa, częściowo lub całkowicie, różnicę między wysokością cen produktów na rynkach światowych i na rynku wewnętrznym UE. Jej poziom może być stały przez okres, bądź częściej zmieniany w zależności od kształtującej się sytuacji na rynku unijnym i światowym. Wykaz produktów objętych systemem refundacji oraz poziom obowiązujących stawek refundacji ustalony jest przez Komisje Europejską i publikowany w Dzienniku Urzędowym UE.

Biorąc pod uwagę fakt, iż stosowane refundacje wywozowe mają charakter dopłat bezpośrednich, źródłem pochodzenia środków finansowych otrzymującego te dopłaty jest Unia Europejska, a celem jest m.in. stabilizacja rynków, w związku z tym powyższe dopłaty stosowane są w ramach Wspólnej Polityki Rolnej Unii Europejskiej i będą korzystały ze zwolnienia przedmiotowego na podstawie art. 17 ust. pkt 36 wyżej cyt. ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych.