W świetle przedstawionego stanu faktycznego wynika, iż przedmiotem działalności Podatnika jest skup pieczarek od rolników.

Naczelnik Urzędu Skarbowego na podstawie art. 14 a § 1 ustawy z 29.08.1997r. Ordynacja podatkowa (Dz. U. Nr 137 poz. 926 ze zm.) wyjaśnia:

W myśl art. 116 ust.1 podatnik zarejestrowany jako podatnik VAT czynny nabywający produkty rolne od rolnika ryczałtowego wystawia w dwóch egzemplarzach fakturę dokumentującą nabycie tych produktów. Oryginał faktury jest przekazywany dostawcy. Faktura ta, powinna zawierać między innymi kwotę zryczałtowanego zwrotu podatku od wartości nabytych produktów rolnych.

Zgodnie z art. 116 ust. 6 ustawy z dnia 11.03.2004 r. o podatku od towarów i usług (Dz. U. z 2004 r. Nr 54, poz. 535) – zryczałtowany zwrot podatku zwiększa u nabywcy produktów rolnych kwotę podatku naliczonego, o której mowa w art. 86 ust. 2, w rozliczeniu za miesiąc, w którym dokonano zapłaty, pod warunkiem, że:

• nabycie produktów rolnych jest związane z dostawą opodatkowaną,
• zapłata należności za produkty rolne, obejmująca również kwotę zryczałtowanego zwrotu podatku, nastąpiła na rachunek bankowy rolnika ryczałtowego nie później niż 14 dnia, licząc od dnia zakupu, z wyjątkiem przypadku, gdy rolnik zawarł umowę z podmiotem nabywającym produkty rolne określającą dłuższy termin płatności.
• w dokumencie stwierdzającym dokonanie zapłaty, o której mowa wpkt 2 zostaną podane numer i data wystawienia faktury potwierdzającej nabycie produktów rolnych.

Nowa ustawa o podatku VAT z dnia 11.03.2004r. nie uregulowała w przepisach przejściowych sytuacji dającej możliwość zwiększenia u nabywcy produktów rolnych kwoty podatku naliczonego o zryczałtowany zwrot podatku od wartości nabytych produktów rolnych, który znajduje się na fakturach RR wystawionych w miesiącach III, IV 2004r. z terminem płatności w miesiącu V , VI 2004r., ale w zakresie materii regulowanej przez ten akt następuje ciągłość – jest to co do zasady wciąż ten sam podatek od wartości dodanej, tyle że dostosowany do wymogów wynikających z VI Dyrektywy.

Można stwierdzić, że kwestia czy faktura została wystawiona pod rządami starych przepisów czy nowych jest kwestią wtórną dla określenia podatku naliczonego z takiej faktury.

Nadal zryczałtowany zwrot podatku zwiększa u nabywcy produktów rolnych kwotę podatku naliczoneg.