W oparciu o stan faktyczny przedstawiony przez podatnika w zapytaniu, Naczelnik Dolnośląskiego Urzędu Skarbowego we Wrocławiu wyjaśnia:
W odniesieniu do faktur wystawionych przez podwykonawców z naliczonym podatkiem 22% za usługę transportu wykonaną na terenie Niemiec, w sytuacji gdy usługa ta winna być rozliczona na zasadach obowiązujących w Niemczech, Spółka nie ma prawa do odliczenia tego podatku.
Zgodnie z art. 108 ust. 1 ustawy z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług (Dz. U. Nr 54, poz. 535), w przypadku gdy osoba prawna, jednostka organizacyjna niemająca osobowości prawnej lub osoba fizyczna wystawi fakturę, w której wykaże kwotę podatku, jest obowiązana do jego zapłaty. Jeżeli jednak tego rodzaju faktura nie dokumentuje czynności opodatkowanej, oznacza to, że skoro obowiązek podatkowy co do czynności określonej w takiej fakturze nie powstanie zgodnie z przepisami prawa – wykazany w niej podatek naliczony – zgodnie z § 14 ust. 2 pkt 2 rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 27 kwietnia 2004 r. w sprawie wykonania niektórych przepisów ustawy o podatku od towarów i usług (Dz. U. Nr 97, poz. 970 ze zm.) nie podlega odliczeniu. Przepis ten stanowi bowiem, że „w przypadku, gdy transakcja udokumentowana fakturą nie podlega opodatkowaniu, (...) faktury te i dokumenty celne nie stanowią podstawy do obniżenia podatku należnego. Biorąc powyższe pod uwagę, faktura wystawiona przez podwykonawcę za usługę transportową z naliczonym podatkiem 22%, która podlega rozliczeniu wg stawek obowiązujących na terenie innego kraju członkowskiego, nie stanowi podstawy do odliczenia podatku naliczonego w Polsce.
Natomiast, podatnik wykonując usługę transportu, gdzie miejscem świadczenia usługi jest jedno państwo członkowskie, a usługa ta nie jest bezpośrednio związana z wewnątrzwspólnotową usługą transportu, o której mowa w art. 28 ust. 1 ustawy z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług (Dz. U. Nr 54, poz. 535), nie świadczy wewnątrzwspólnotowej usługi transportu. Zatem winien wystawić fakturę na zasadach obowiązujących w Niemczech i w tym kraju rozliczyć podatek z tyt. tej usługi.
W przedmiotowej sprawie wykonywane przez podatnika usługi transportowe na terenie Niemiec nie podlegają opodatkowaniu w Polsce, więc bez znaczenia jest fakt, iż podatnik wystawił fakturę dla niemieckiego nabywcy z adnotacją, iż miejscem opodatkowania usługi są Niemcy i obowiązek podatkowy przerzucony jest na nabywcę. Tym samym, zafakturowana poza VAT-em usługa transportowa wykonana w Niemczech, pozostaje bez wpływu dla potrzeb rozliczenia podatku od towarów i usług w Polsce.
Polski organ podatkowy nie jest władny do roztrzygania, czy właściwie (zgodnie z regulacjami niemieckiego prawa podatkowego) wystawiono fakturę VAT, która winna być rozliczana w Niemczech dla niemieckiego kontahenta. W takim zakresie władne do udzielenia odpowiedzi będą niemieckie władze skarbowe.