Z treści pisma podatnika uzupełnionego informacją złożoną telefonicznie wynika, że:

• prowadzi działalność gospodarczą w formie spółki cywilnej razem z małżonką,

-przedmiotowa działalność od połowy lat dziewięćdziesiątych była prowadzona w należącym do małżonków obiekcie gospodarczym zlokalizowanym na własnej działce budowlanej, budynek ten został wybudowany w latach 1970-1990 przez podatnika,

• w 2000 r. budynek wpisano do ewidencji środków trwałych o wartości początkowej zero z powodu braku wyceny,
• od drugiej połowy 2003 r. rozpoczęto modernizację wyżej określonego obiektu.

Wpisanie nieruchomości o wartości początkowej „0” do ewidencji środków trwałych nie znajduje oparcia w przepisach ustawy z dnia 26 lipca 1991 r. o podatku dochodowym od osób fizycznych (Dz. U. z 2000 r. nr 14 poz. 176 ze zm.). W sytuacji wytworzenia środka trwałego we własnym zakresie wartością początkową, która stanowi podstawę naliczania odpisów amortyzacyjnych zgodnie z art. 22 g wymienionej ustawy jest koszt wytworzenia. Unormowania art. 22g ust. 4 precyzują co należy uznać za koszt wytworzenia środka trwałego. Zgodnie z powyższym przepisem za koszt wytworzenia uważa się wartość, w cenie nabycia, zużytych do wytworzenia środków trwałych: rzeczowych składników majątku i wykorzystanych usług obcych, kosztów wynagrodzeń za prace wraz z pochodnymi i inne koszty dające się zaliczyć do wartości wytworzonych środków trwałych. Do kosztu wytworzenia nie zalicza się wartości własnej pracy podatnika, jego małżonka i małoletnich dzieci, kosztów ogólnych zarządu, kosztów sprzedaży oraz pozostałych kosztów operacyjnych i kosztów operacji finansowych, w szczególności odsetek od pożyczek (kredytów) i prowizji, z wyłączeniem odsetek i prowizji naliczonych do dnia przekazania środka trwałego do używania.

Natomiast w sytuacji gdy podatnik nie może ustalić kosztu wytworzenia, wartość początkową środka trwałego ustala się w oparciu o art. 22 g ust. 9, który stanowi - jeżeli podatnik nie może ustalić kosztu wytworzenia, o którym mowa w ust. 4, wartość początkową środków trwałych ustala się w wysokości określonej z uwzględnieniem cen rynkowych, o których mowa w ust. 8, przez biegłego, powołanego przez podatnika. Przy czym podatnik nie ma prawa dodania do tak ustalonej wartości początkowej wydatków poniesionych (i udokumentowanych) od 2003 r.

Zgodnie z art. 22j ust. 3 środki trwałe, o których mowa w ust. 1 pkt 3, czyli budynki (lokale) i budowle (...) uznaje się za używane – jeżeli podatnik wykaże, że przed ich nabyciem były wykorzystywane co najmniej przez okres 60 miesięcy. Zdaniem organu podatkowego ponieważ, w danym przypadku nie nastąpiło nabycie nieruchomości (według wyjaśnienia telefonicznego podatnika), nie może mieć zastosowania powyższy przepis.

Podobnie przedmiotowej nieruchomości nie można uznać jako środek trwały ulepszony, gdyż środki trwałe zgodnie z art. 22j ust. 3 pkt 2 uważa się za ulepszone – jeżeli przed wprowadzeniem do ewidencji wydatki poniesione przez podatnika na ich ulepszenie stanowiły co najmniej 30% wartości początkowej, a w danym przypadku nie było wyceny wartości początkowej przed ich modernizacją.

Odpis amortyzacyjny będzie kosztem uzyskania przychodu jedynie w sytuacji gdy poniesione wydatki na wytworzenie środka trwałego we własnym zakresie nie zostały odliczone od podstawy opodatkowania podatkiem dochodowym albo zwrócone podatnikowi w jakiejkolwiek formie zgodnie z uregulowaniami art. 23 ust. 1 pkt 45 ustawy.

Umowy spółki cywilnej, zgodnie z art. 1 ust. 1 pkt 1 lit. k ustawy o podatku od czynności cywilnoprawnych z dnia 09.09.2000 r. (Dz. U. nr 86, poz. 959 ze zm.) podlegają podatkowi od czynności cywilnoprawnych. Opodatkowaniu podlegają również zmiany tej umowy, jeżeli powodują podwyższenie podstawy obliczenia tego podatku. Zgodnie z art. 1 ust. 3 ustawy za zmianę umowy spółki uważa się przy spółce cywilnej lub jawnej podwyższenie wniesionego do spółki wkładu, którego wartość powoduje zwiększenie majątku spółki lub podwyższenie kapitału zakładowego. Z treści pisma podatnika wynika, że nieruchomość zostanie wyceniona przez rzeczoznawcę majątkowego i w najbliższym czasie zostanie wprowadzona do spółki cywilnej jako majątek spółki, zatem zgodnie z wyżej powołanymi przepisami wystąpi obowiązek uiszczenia podatku od czynności cywilnoprawnych.