Zgodnie z art. 29 ust. 1 ustawy z dnia 11 marca 2004r. o podatku od towarów i usług /Dz. U. Nr 54 poz. 535/ podstawą opodatkowania tym podatkiem jest obrót. Obrotem zaś jest kwota należna z tytułu sprzedaży, pomniejszona o kwotę należnego podatku. Od 01 maja 2004r. obrotem jest również otrzymana dotacja, subwencja i inna dopłata o podobnym charakterze związana z dostawą lub świadczeniem usług.

Do stwierdzenia, że dana dotacja (subwencja) zwiększa podstawę opodatkowania podatkiem od towarów i usług, niezbędne jest ustalenie czy tego typu dofinansowanie wiąże się ściśle z ceną konkretnego świadczenia lub czy stanowi rekompensatę z tytułu wykonywania określonego świadczenia po cenach obniżonych. W takim bowiem przypadku otrzymana dotacja (subwencja) powinna zaliczana być do podstawy opodatkowania podatkiem od towarów i usług.

Natomiast w przypadku otrzymania dotacji (subwencji) służących pokryciu całości lub części kosztów ogólnej działalności podatnika, gdy nie istnieje możliwość bezpośredniego powiązania otrzymanego dofinansowania z ceną konkretnych dostaw towarów lub świadczenia konkretnych usług, wówczas brak jest podstaw do uznania, że taka dotacja (subwencja) podlega automatycznemu zaliczeniu do podstawy opodatkowania podatkiem VAT. Wobec powyższego dotacje mające na celu dofinansowanie działalności, nie uzależnione od ilości i wartości świadczonych usług, nie podlegają opodatkowaniu podatkiem od towarów i usług.

Zgodnie z art. 19 ust. 21 ustawy z dnia 11 marca 2004r. obowiązek podatkowy z tytułu należnych na podstawie odrębnych przepisów dotacji, subwencji i innych dopłat o podobnym charakterze powstaje z chwilą uznania rachunku bankowego podatnika. W przypadku uznania rachunku bankowego podatnika zaliczką z tytułu dotacji, subwencji i innych dopłat o podobnym charakterze obowiązek podatkowy powstaje w tej części.

Wobec powyższego obowiązek podatkowy z tytułu sprzedaży wyrobów częściowo lub całkowicie refundowanych powstaje z chwilą wydania przedmiotowego towaru i podlega obowiązkowi ewidencjonowania za pomocą kasy fiskalnej. Obowiązek podatkowy z tytułu otrzymanej refundacji powstaje z chwilą uznania rachunku bankowego podatnika. W świetle powyższego podstawą opodatkowania w przypadku sprzedaży wyrobów częściowo lub całkowicie refundowanych będzie obrót pomniejszony o kwote refundacji, która będzie podlegała opodatkowaniu w momencie uznania rachunku bankowego Spółki.