Ustawa z dnia 11 marca 2004r. o podatku od towarów i usług /Dz. U. Nr 54, poz. 535/ nie przewiduje, aby zakłady (oddział) samodzielnie sporządzające bilans, które na mocy art. 5 ust. 2 ustawy z dnia 08 stycznia 1993r. o podatku od towarów i usług oraz podatku akcyzowym /Dz. U. Nr 11, poz. 50 ze zm./ były odrębnymi podatnikami podatku VAT. Artykuł 160 ust. 3 powołanej na wstępie ustawy stanowi, iż osoba prawna, której zakłady rozliczały się jako odrębni podatnicy, z dniem 01 maja 2004r. wstępuje we wszystkie przewidziane w przepisach prawa podatkowego prawa i obowiązki swojego zakładu (oddziału), który przestał być odrębnym podatnikiem.

Utrata statusu podatnika podatku od towarów i usług powoduje, iż zakłady osoby prawnej nie będą mogły już wystawiać faktur VAT na własny rachunek, ale wyłącznie w imieniu przedsiębiorstwa (jako całości, z jej numerem identyfikacyjnym), z zaznaczeniem adresu, pod jakim mieścił się oddział. Numeracja faktur powinna być również oddzielona dla poszczególnych oddziałów.

Zgodnie z przepisami określonymi w par. 11 ust. 1 Rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 27 kwietnia 2004r. w sprawie zwrotu podatku niektórym podatnikom, zaliczkowego zwrotu podatku, zasad wystawiania faktur, sposobu ich przechowywania oraz listy towarów i usług, do których nie mają zastosowania zwolnienia od podatku od towarów i usług – Faktury oznaczone wyrazami „FAKTURA VAT” obowiązani są wystawiać zarejestrowani podatnicy jako podatnicy VAT czynni, posiadający numer identyfikacji podatkowej NIP.

Reasumując, zgodnie z powołanymi przepisami Oddział, który zgodnie z przepisami obowiązującymi od dnia 01 maja 2004r. utracił status podatnika VAT, nie jest podmiotem uprawnionym do wystawiania oraz odbierania faktur VAT. Faktury stwierdzające dokonanie sprzedaży lub zakupu winny zawierać dane jednostki nadrzędnej – jako całości oraz adres, pod jakim mieści się Oddział.