Przekształcenie prawa użytkowania wieczystego nieruchomości gruntowej w prawo własności, co do zasady, powinno zostać zaliczone do dostawy towarów, jest to bowiem przeniesienie prawa do rozporządzania towarami jak właściciel. Zmiana formy prawnej nieruchomości gruntowej nazywana potocznie ,,przekształceniem prawa wieczystego użytkowania gruntu we własność” może jednak przybrać dwie postacie:

1. wygaśnięcie prawa użytkowania wieczystego, a następnie odpłatne przeniesienie własności gruntu,

2. przekształcenie w trybie przepisów ustawy z dnia 4 września 1997r. o przekształceniu prawa użytkowania wieczystego przysługującego osobom fizycznym w prawo własności (Dz.U. z 2001r. Nr 12, poz. 1299).

W zależności od tego z jakim ,,przekształceniem” mamy do czynienia różne są jego konsekwencje podatkowe.

I tak, w pierwszym przypadku mamy do czynienia z wygaśnięciem prawa wieczystego użytkowania i dostawą gruntu jako odrębną czynnością cywilnoprawną. Ponieważ zgodnie z definicją zawartą w art. 2 pkt 6 ustawy z dnia 11 marca 2004r. o podatku od towarów i usług (Dz.U. Nr 54, poz. 535)towarami są również grunty - odpłatne przeniesienie prawa własności gruntu stanowi dostawę towaru, o której mowa w art. 7 ust. 1 ustawy o podatku od towarów i usług. Czynność ta podlega opodatkowaniu stawką 22% (z wyjątkiem terenów niezabudowanych innych niż tereny budowlane oraz przeznaczone pod zabudowę – art. 43 ust. 1 pkt 9 ustawy).

W przypadku natomiast, gdy zastosowane zostaną przepisy ustawy z dnia 4 września 1997r. o przekształceniu prawa użytkowania wieczystego w prawo własności, wówczas zostaje wydana decyzja administracyjna w sprawie przekształcenia prawa użytkowania wieczystego w prawo własności. Decyzja ta stanowi podstawę wpisu w księdze wieczystej. Ponieważ zaś, zgodnie z art. 15 ust. 6 ustawy o podatku VAT, nie uznaje się za podatnika organów władzy publicznej w zakresie realizowanych zadań nałożonych odrębnymi przepisami prawa (za wyjątkiem czynności wykonywanych na podstawie zawartych umów cywilnoprawnych), przekształcenia w formie decyzji administracyjnych nie są objęte podatkiem VAT.

Ponadto, w zakresie opodatkowania podatkiem od towarów i usług opłat za wieczyste użytkowanie gruntu, należy zauważyć, iż rozporządzeniem Ministra Finansów z dnia 28 stycznia 2005r. (opubl. w Dz.U. z dnia 31 stycznia 2005r. Nr 17, poz. 150), został uchylony § 3a rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 27 kwietnia 2004r. w sprawie wykonania niektórych przepisów ustawy o podatku od towarów i usług tj. przepis powołany w wyjaśnieniach Naczelnika Urzędu Skarbowego z dnia 13 grudnia 2004r. Jednocześnie w § 2 rozporządzenia z dnia 28 stycznia 2005r. określono,że w przypadku pobrania po dniu 24 czerwca 2004r. a przed dniem wejścia w życie tego rozporządzenia (tj. przed dniem 14 lutego 2005r.), całości lub części należności z tytułu oddania w użytkowanie wieczyste nieruchomości gruntowych – przed upływem terminu ich płatności – obowiązek podatkowy z tytułu pobrania tych należności powstaje z chwilą upływu terminu płatności poszczególnych opłat.

Wprowadzenie powyższych uregulowań powoduje, iż w odniesieniudo wpłat należności z tytułu opłat za wieczyste użytkowanie gruntu, dokonywanych po dniu 14 lutego 2005r. obowiązek podatkowy powstaje zgodnie z art. 19 ust. 11 ustawy z dnia 11 marca 2004r. o podatku od towarów i usług (Dz.U. nr 54, poz.535) tj. z chwilą otrzymania każdej raty.