Ze skierowanego do tutejszego organu podatkowego wniosku wynika, że Podatniczka zajmuje się głównie sprzedażą samochodów używanych. Sprzedając samochody używane (zarówno będące własnością podatniczki , jak też w systemie sprzedaży komisowej) stosuje przepis art. 120 ust. 4 ustawy z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług (Dz. U. Nr 54, poz. 535 z późn. zm.). Według Podatniczki przy obliczaniu proporcji na podstawie art. 90 ust. 3 ustawy należy brać pod od uwagę wyłącznie wartość marży netto, gdyż pozostała wartość wynikająca z dokonanej sprzedaży nie jest ewidencjonowana jako sprzedaż opodatkowana. Strona dokonuje zarówno dostaw opodatkowanych podatkiem od towarów i usług ( VAT ) jak i zwolnionych. Podatniczka pyta czy wartość samochodu zawarta w cenie sprzedaży, która nie podlega opodatkowaniu ( ale i nie jest zwolniona) powinna być uwzględniona w ogólnej wartości obrotu przy obliczaniu proporcji, o której mowa w art. 90 ust. 2 ustawy o podatku od towarów i usług .
Opowiadając na zadane pytanie należy stwierdzić, że od 1 maja 2004 r. umowy komisu nie są już świadczeniem usług a dostawą towarów. W myśl bowiem art. 7 ust. 1 pkt 3 ustawy z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług (Dz. U. Nr 54, poz. 535) przez dostawę towarów o której mowa w art. 5 ust. 1 pkt 1 rozumie się przeniesienie prawa do rozporządzania towarem jak właściciel, w tym również wydanie towarów na podstawie umowy komisu: między komitentem a komisantem, jak również wydanie towarów przez komisanta osobie trzeciej. Zgodnie z art. 30 ust. 1 pkt 2 cytowanej ustawy podstawą opodatkowania czynności maklerskich, czynności wynikających z zarządzania funduszami powierniczymi, czynności wynikających z umowy agencyjnej lub zlecenia, pośrednictwa, umowy komisu lub innych usług o podobnym charakterze stanowi dla komisanta kwota należna z tytułu dostawy towarów, pomniejszona o kwotę podatku w przypadku dostawy towarów osobie trzeciej, na rachunek komitenta. W świetle powyższego w przypadku wydania (sprzedaży) osobie trzeciej samochodu będącego przedmiotem umowy komisu, podstawą opodatkowania jest kwota należna z tytułu dostawy towarów, pomniejszona o kwotę podatku.
Podkreślić jednak należy, że podatnik dokonujący dostawy towarów używanych (dotyczy to zarówno klasycznego systemu kupna-sprzedaży, jak również sprzedaży w systemie komisowym) może skorzystać ze szczególnych procedur w zakresie opodatkowania. Zgodnie bowiem z art. 120 ust. 4 i 5 ustawy o podatku od towarów i usług w przypadku podatnika wykonującego czynności polegające na dostawie towarów używanych, dzieł sztuki, przedmiotów kolekcjonerskich lub antyków nabytych uprzednio przez tego podatnika dla celów prowadzonej działalności lub importowanych w celu odprzedaży, podstawą opodatkowania podatkiem jest marża stanowiąca różnicę między całkowitą kwotą, która ma zapłacić nabywca, a kwotą nabycia, pomniejszoną o kwotę podatku. Jeżeli rodzaj poszczególnych przedmiotów kolekcjonerskich lub specyfika ich dostaw czyni skomplikowanym lub niemożliwym określenie marży zgodnie z ust. 4, podatnik może, za zgodą naczelnika urzędu skarbowego, obliczać marżę jako różnicę pomiędzy łączną wartością dostaw a łączną wartością nabyć określonego rodzaju przedmiotów kolekcjonerskich w okresie rozliczeniowym.

Zgodnie z art. 120 ust. 10 cytowanej ustawy, przepis ust. 4 i 5 dotyczą dostawy towarów używanych, które podatnik nabył od:
1) osoby fizycznej, osoby prawnej lub innej jednostki organizacyjnej niemającej osobowości prawnej, nie będącej podatnikiem, o którym mowa w art. 15, lub niebędącej podatnikiem podatku od wartości dodanej,
2) podatników, o których mowa w art. 15 jeżeli dostawa tych towarów była zwolniona od podatku na podstawie art. 43 ust. 1 pkt 2 lub art. 113 ustawy o VAT
3) podatników, jeżeli dostawa tych towarów była opodatkowana zgodnie z ust. 4 i 5 ustawy o VAT,
4) podatników podatku od wartości dodanej, jeżeli dostawa tych towarów była zwolniona od podatku na zasadach odpowiadających regulacjom zawartym w art. 43 ust. 1 pkt 2 lub art. 113,
5) podatników podatku od wartości dodanej, jeżeli dostawa tych towarów była opodatkowana podatkiem od wartości dodanej na zasadach odpowiadających regulacjom zawartym w ust. 4 i 5, a nabywca posiada dokumenty jednoznacznie potwierdzające nabycie towarów na tych zasadach.
Na potrzeby dokonywania rozliczeń wg procedur szczególnych przez towary używane rozumie się ruchome dobra materialne nadające się do dalszego użytku w ich aktualnym stanie lub po naprawie, inne niż określone w pkt 1-3 oraz inne niż metale szlachetne lub kamienie szlachetne (art. 120 ust. 2 pkt 4 ustawy o VAT). Łączne spełnienie wymienionych warunków uprawnia podatnika do zastosowania opodatkowania dostaw towarów używanych w systemie marży. Podatnik może również stosować ogólne zasady opodatkowania do dostaw do których stosuje się przepisy art. 120 ust. 10 i 11 na podstawie art. 120 ust. 14 cyt. ustawy o podatku od towarów i usług. Zasady ogólne są też stosowane w sytuacji gdy nie są spełnione warunki do zastosowania systemu marży.
Natomiast zgodnie z art. 120 ust. 15 ustawy z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług "jeżeli podatnik oprócz zasad, o których mowa w ust. 4 i 5, stosuje również ogólne zasady opodatkowania, to jest on obowiązany prowadzić ewidencją zgodnie z art. 109 ust. 3 z uwzględnieniem podziału w zależności od sposobu opodatkowania; w odniesieniu do dostawy, o której mowa w ust. 4 i 5, ewidencja musi zawierać w szczególności kwoty nabycia towarów niezbędne do określenia kwoty marży, o której mowa w tych przepisach". Faktury dokumentujące czynności, których podstawą opodatkowania jest marża wystawia się na zasadach określonych w § 12 ust. 8 rozporządzenia Ministra Finansów z dn. 27 kwietnia 2004 r. w sprawie zwrotu podatku niektórym podatnikom, zaliczkowego zwrotu podatku, zasad wystawiania faktur, sposobu ich przechowywania oraz listy towarów i usług, do których nie mają zastosowania zwolnienia od podatku od towarów i usług (Dz. U. Nr 97, poz. 971). Zgodnie z tym przepisem - ... faktury dokumentujące czynności, których podstawą opodatkowania jest marża, zgodnie z art. 120 ustawy, zawierają dane określone w ust. 1 pkt 1-5 i 12, oraz wyrazy "VAT-marża".

Reasumując, przy sprzedaży samochodów używanych, zarówno w sprzedaży komisowej jak i przy normalnej dostawie, w przypadku zachowania warunków wynikających z art. 120 ust. 10 ustawy o podatku od towarów i usług, możliwe jest zastosowanie procedury szczególnej, polegającej na opodatkowaniu marży, rozumianej jako różnica pomiędzy ceną nabycia a ceną sprzedaży. W tym przypadku w deklaracji podatkowej VAT-7 wykazywana jest podstawa opodatkowania czyli marża. W razie braku możliwości zastosowania opodatkowania marży od sprzedawanych samochodów podatnik zobowiązany jest obliczać VAT od pełnej należności za sprzedawane samochody. W tym przypadku w deklaracji wykazana być winna jako podstawa opodatkowania kwota należna pomniejszona o kwotę podatku pobranego od dostawy.
W przypadku dokonywania przez Stronę sprzedaży towarów używanych opodatkowanych na zasadach marży (zarówno w systemie kupna-sprzedaży „auto-handel”, jak również systemie sprzedaży komisowej po spełnieniu warunków uprawniających do wyboru tej formy opodatkowania) - podstawą opodatkowania podatkiem VAT jest marża zgodnie z cyt. uprzednio art. 120 ust. 4 ustawy o podatku od towarów i usług. Marża ta winna być włączona do określania proporcji wskazanej w art. 90 ust. 3 ustawy , powiększając wartość ogólnego obrotu. W przypadku sprzedaży podlegającej opodatkowaniu w systemie marży, zgodnie z art. 120 ust. 19 ustawy - obniżenia kwoty lub zwrotu różnicy podatku należnego nie stosuje się do nabywanych przez podatnika towarów używanych, dzieł sztuki, przedmiotów kolekcjonerskich i antyków, jeżeli podlegały opodatkowaniu zgodnie z ust. 4 i 5. W świetle przepisów- art. 90 ust 1 ustawy o podatku od towarów i usług- w stosunku do towarów i usług, które są wykorzystywane przez podatnika do wykonywania czynności, w związku z którymi przysługuje prawo do obniżenia kwoty podatku należnego, jak i czynności, w związku z którymi takie prawo nie przysługuje, podatnik jest obowiązany do odrębnego określenia kwot podatku naliczonego związanych z czynnościami, w stosunku do których podatnikowi przysługuje prawo do obniżenia kwoty podatku należnego. Ust. 2 i 3 art 90 stanowią „jeżeli nie jest możliwe wyodrębnienie całości lub części kwot, o których mowa w ust. 1, podatnik może pomniejszyć kwotę podatku należnego o taką część kwoty podatku naliczonego, którą można proporcjonalnie przypisać czynnościom, w stosunku do których podatnikowi przysługuje prawo do obniżenia kwoty podatku należnego, z zastrzeżeniem ust. Proporcję, o której mowa w ust. 2, ustala się jako udział rocznego obrotu z tytułu czynności, w związku z którymi przysługuje prawo do obniżenia kwoty podatku należnego, w całkowitym obrocie uzyskanym z tytułu czynności, w związku z którymi podatnikowi przysługuje prawo do obniżenia kwoty podatku należnego, oraz czynności, w związku z którymi podatnikowi nie przysługuje takie prawo”.Wobec powyższego, według tutejszego organu podatkowego, wskazana we wniosku "wartość samochodu zawarta w cenie sprzedaży, która nie podlega opodatkowaniu" nie powinna być brana do proporcji o której mowa w art. 90 ust. 3 cyt. ustawy o podatku od towarów i usług.
Zatem stanowisko Podatniczki zawarte we wniosku jest prawidłowe.