Zgodnie z art. 76 § 1 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. Ordynacja Podatkowa (Dz. U. Nr 137 poz. 926) nadpłaty wraz z ich oprocentowaniem podlegają zaliczeniu z urzędu na poczet zaległości podatkowych wraz z odsetkami za zwłokę oraz bieżących zobowiązań podatkowych, a w razie ich braku podlegają zwrotowi z urzędu, chyba że podatnik złoży wniosek o zaliczenie nadpłaty w całości lub części na poczet przyszłych zobowiązań podatkowych.

Przepis art. 76b powyższej ustawy stanowi, iż przepisy art. 76 stosuje się odpowiednio do zwrotu podatku. Przy czym zaliczenie następuje z dniem złożenia deklaracji wykazującej zwrot podatku.

Reasumując pomimo zmian wprowadzonych ustawą z dnia 27 czerwca 2003 r. o utworzeniu Kolegiów Skarbowych oraz o zmianie niektórych ustaw regulujących zadania i kompetencje organów oraz organizację jednostek organizacyjnych podległych ministrowi właściwemu do spraw finansów publicznych (Dz. U. nr 137 poz. 1302) nie widać formalnych przeciwwskazań do przerachowania -zgodnie z wnioskiem Strony -nadwyżki podatku naliczonego nad należnym wykazanym przez Spółkę do zwrotu na rachunek bankowy na poczet podatku akcyzowego .