Weryfikując pismo Naczelnika Urzędu Skarbowego Kraków - Stare Miasto z dnia 09.01.2004 r. Nr DP-423/45/2003 stanowiące pisemną informację w zakresie stosowania przepisów prawa podatkowego wydaną z trybie art. 14a § 1 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. Ordynacja podatkowa (Dz.U. Nr 137, poz. 926 ze zm.), Dyrektor Izby Skarbowej w Krakowie, działając na podstawie art. 14b § 2 wymienionej ustawy stwierdza, co następuje:

W związku z wejściem w życie z dniem 01.09.2003 r. ustawy z dnia 27 czerwca 2003 r. (Dz.U. Nr 137, poz. 1302) o utworzeniu Wojewódzkich Kolegiów Skarbowych oraz o zmianie niektórych ustaw regulujących zadania i kompetencje organów oraz organizację jednostek organizacyjnych podległych ministrowi właściwemu do spraw finansów publicznych, Minister Finansów korzystając z uprawnień wynikających z delegacji ustawowej określonej w art. 15 pkt 1 lit. j) utworzył od dnia 01.01.2004r. urzędy skarbowe do obsługi niektórych kategorii podatników określonych w art. 5 ust. 9b nowelizowanej ustawy z dnia 21 czerwca 1996r. o urzędach i izbach skarbowych (Dz.U. Nr 106, poz. 489 ze zm.).

Cechy podmiotów, które będą podlegały właściwości nowo utworzonych urzędów mają:
1. charakter podmiotowy, gdy podatnik jest;
a) podatkową grupą kapitałową,
b) bankiem,
c) zakładem ubezpieczeń,
d) jednostką, działającą na podstawie przepisów o publicznym obrocie papierami wartościowymi oraz przepisów o funduszach inwestycyjnych,
e) jednostką działającą na podstawie przepisów o funduszach emerytalnych,
f) oddziałem lub przedstawicielstwem przedsiębiorstwa zagranicznego lub
2. charakter przedmiotowy, gdy podatnik będący osobą prawną lub jednostką organizacyjną nieposiadającą osobowości prawnej:
a) w ostatnim roku podatkowym osiągnął przychód roczny netto co najmniej 5 mln euro,
b) jako rezydent bierze udział bezpośrednio lub pośrednio w zarządzaniu przedsiębiorstwami położonymi za granicą lub w ich kontroli albo posiada udział w ich kapitale,
c) jest zarządzany bezpośrednio lub pośrednio przez nierezydenta lub nierezydent posiada co najmniej 5 % głosów na zgromadzeniu wspólników na walnym zgromadzeniu,
d) jako rezydent jednocześnie bezpośrednio lub pośrednio bierze udział w zarządzaniu podmiotem krajowym i zagranicznym lub w jego kontroli albo posiada jednocześnie udział w kapitale takich podmiotów.

Zgodnie z art. 5 ust. 9b pkt 7 lit. a) ustawy o urzędach i izbach skarbowych wyznaczenie terytorialnego zasięgu działania określonego urzędu skarbowego może dotyczyć osób prawnych lub jednostek organizacyjnych nieposiadających osobowości prawnej, które w ostatnim roku podatkowym osiągnęły przychód netto ze sprzedaży towarów, wyrobów i usług o równowartości co najmniej 5 mln euro. Przepis ten dotyczy osób prawnych i jednostek organizacyjnych nieposiadających osobowości prawnej osiągających przychody dla celów opodatkowania podatkiem dochodowym.

Spółki cywilne, jawne, partnerskie czy komandytowe nie osiągają przychodów podlegających opodatkowaniu podatkiem dochodowym. Podatnikami, dla celów podatku dochodowego są poszczególni wspólnicy (partnerzy, komandytariusze). Mając na uwadze powyższe, spółki cywilne oraz osobowe spółki handlowe, nie będą objęte właściwością naczelnika wyspecjalizowanego urzędu skarbowego w zakresie rozliczeń jakiegokolwiek podatku.

A zatem w konkretnej sytuacji, właściwym organem podatkowym dla nowoutworzonej spółki komandytowo - akcyjnej będzie naczelnik dotychczasowego urzędu skarbowego.