Pismem z dnia 25.07.2005 r., uzupełnionym dnia 29.07.2005 r., Spółka zwróciła się z prośbą o udzielenie pisemnej interpretacji co do zakresu i sposobu zastosowania prawa podatkowego, przedstawiając następujący stan faktyczny:
Firma - wspólnie z Uniwersytetem (...) oraz (...) Szkołą Ekonomiczną w (...) - opracowała i złożyła do Urzędu Marszałkowskiego województwa (...) w ramach konkursu nr (...) wniosek o dofinansowanie projektu pn. "Podlaskie Centrum Innowacji" w ramach Zintegrowanego Programu Operacyjnego Rozwoju Regionalnego, Działanie 2.6 "Regionalne Strategie Innowacyjne i Transfer Wiedzy". Projekt ten uzyskał dofinansowanie na podstawie umowy nr (...) zawartej pomiędzy Uniwersytetem (...) (jako Liderem projektu) a Urzędem Marszałkowskim województwa (...).
Zgodnie z przyjętym wnioskiem o dofinansowanie sp. z o.o. będzie przygotowywała rozwiązania informatyczne niezbędne dla prawidłowej realizacji założeń projektu (przygotowanie aplikacji bazodanowych na potrzeby projektu i serwisowanie ich, wdrożenie obiegu dokumentów pomiędzy uczestnikami projektu na płaszczyźnie regionalnej i w obszarach funkcjonalnych), będzie również uczestniczyć w akwizycji proponowanych przez PCI ofert skierowanych do sektora MSP, umożliwi też przeprowadzenie warsztatów i szkoleń dla przedsiębiorców - zwłaszcza w obszarze tematyki Społeczeństwa Informacyjnego - w oparciu o posiadaną bazę lokalową i informatyczną".
Ogólne zasady współpracy partnerskie pomiędzy firmą (...)sp. z o.o jako Partnerem projektu a Uniwersytetem (...) jako Liderem projektu ustanawia porozumienie partnerskie z dnia 08/12/2004 r. stanowiące załącznik do wyżej wspomnianego wniosku o dofinansowanie.

Dotacja na realizację projektu "Podlaskie Centrum Innowacji" sp. z o.o. nie ma bezpośredniego wpływu na cenę dostaw i usług świadczonych przez sp. z o.o. w ramach realizacji projektu.
Środki finansowe pochodzące z dotacji zostaną przekazane na wyodrębniony rachunek bankowy.

Zgodnie z treścią punktu 1b załącznika 1 do tego porozumienia" sp. z o.o w ramach projektu wykona następujące zadania:
Wykonanie specyfikacji funkcjonalnej baz i witryny internetowej Podlaskiego Centrum Innowacji w odniesieniu do założonych w projekcie wymogów tj. baz danych zespołu ekspertów z dziedziny kluczowych technologii z punktu widzenia rozwoju regionu:
- wykonanie specyfikacji funkcjonalnej oraz projektu technicznego oprogramowania baz informacyjnych oraz witryny internetowej Podlaskiego Centrum Innowacji,
- wykonanie oprogramowania zgodnie z opracowaną dokumentacją,zainstalowanie, skonfigurowanie i uruchomienie wykonanego oprogramowania,
- serwisowanie i nadzór autorski nad dostarczonym oprogramowaniem w okresie realizacji projektu,
- akwizycja proponowanych przez PCI ofert skierowanych do sektora MSP,przeprowadzanie warsztatów i szkoleń dla przedsiębiorców,
- zasilanie baz Podlaskiego Centrum Innowacji danymi pochodzącymi z akwizycji wśród klientów instytucjonalnych firmy (...), będących firmami innowacyjnymi,
- udostępnienie przestrzeni dyskontowej na serwerach (...)".
Umowa o zasadach współpracy partnerskiej z dnia 29 kwietnia zawarta pomiędzy Uniwersytetem (...) a sp. z o.o szczegółowo reguluje m.in. zagadnienia związane z przekazywaniem i rozliczaniem dotacji pomiędzy stronami.

Spółka zwraca się z pytaniem: czy kwota dotacji uzyskana przez podatnika związanej z realizacją projektu pn. "Podlaskie Centrum Innowacji" jest opodatkowana podatkiem VAT.

Spółka sformułowała też własne stanowisko w sprawie stwierdzając, iż:Zgodnie z art. 29 ust. 1 ustawy z dnia 11 maca 2004 r. o podatku od towarów i usług (Dz.U. z 2004 r. nr 54 poz. 535 z późn. zm.) "obrót zwiększa się o otrzymane dotacje(...) mające bezpośredni wpływ na cenę (kwotę należną) towarów dostarczanych lub usług świadczonych przez podatnika, pomniejszone o kwotę należnego podatku".Dotacja na realizację projektu "Podlaskie Centrum Innowacji" nie ma bezpośredniego wpływu na cenę dostaw i usług świadczonych przez sp. z o.o. w ramach projektu, ponieważ jest to dotacja przeznaczona na refundację kosztów związanych z ogólną działalnością podatnika, takich jak:wynagrodzenie personelu,koszty lokalowe,koszty materiałów eksploatacyjnych (papier, tonery itp.),koszty marketingu i PR, usług telekomunikacyjnych, poligraficznych,koszt opłat licencyjnych oprogramowania.Zatem kwota dotacji uzyskana przez sp. z o.o. związanej z realizacją wyżej opisanego projektu pn. "Podlaskie Centrum Innowacji" nie podlega opodatkowaniu podatkiem VAT.

Naczelnik Pierwszego Urzędu Skarbowego w Białymstoku mając na uwadze stan faktyczny przedstawiony przez wnioskodawcę i stan prawny obowiązujący w dacie zaistnienia tego zdarzenia, postanawia udzielić następującej interpretacji, co do zakresu i sposobu zastosowania prawa podatkowego.

W myśl art. 29 ust. 1 ustawy z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług (Dz.U. Nr 54, poz. 535 z późn. zm.) podstawą opodatkowania jest obrót. Obrotem zaś, jest kwota należna z tytułu sprzedaży, pomniejszona o kwotę należnego podatku. Kwota należna obejmuje całość świadczenia należnego od nabywcy.
Obrót zwiększa się o otrzymane dotacje, subwencje i inne dopłaty o podobnym charakterze mające bezpośredni wpływ na cenę (kwotę należną) towarów dostarczanych lub usług świadczonych przez podatnika, pomniejszone o kwotę należnego podatku.

W przypadku zaś otrzymania dotacji na realizację danego projektu, gdzie nie ma możliwości powiązania otrzymanego dofinansowania z ceną konkretnej dostawy bądź świadczenia konkretnej usługi, wówczas brak jest podstaw aby uznać, iż taka dotacja stanowi podstawę opodatkowania w podatku VAT. Zatem, przedmiotowa dotacja otrzymana przez sp. z o.o. nie podlega opodatkowaniu podatkiem od towarów i usług, gdyż nie jest możliwe powiązanie tejże dotacji z ceną konkretnych dostaw lub świadczeniem konkretnych usług świadczonych przez Spółkę.