Naczelnik Urzędu Skarbowego Kraków - Nowa Huta działając na podstawie art. 14 a ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. - Ordynacja podatkowa (Dz. U. Nr 137 z 1997 r., poz. 926 ze zm.) w odpowiedzi na pismo z dnia 01.10.2004 r. (uzupełnione w dniu 14.10.2004 r.) w sprawie zwrotu nadwyżki podatku naliczonego nad należnym wyjaśnia, co następuje:
Zgodnie z art. 87 ust. 1 ustawy z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług (Dz. U. Nr 54 z 2004 r., poz. 535) w przypadku, gdy kwota podatku naliczonego jest w okresie rozliczeniowym wyższa od kwoty podatku należnego, podatnik ma prawo do obniżenia o tę różnicę kwoty podatku należnego za następne okresy lub do zwrotu różnicy na rachunek bankowy.
Zgodnie z art. 87 ust. 2 ww. ustawy zwrot różnicy podatku następuje na rachunek bankowy podatnika w banku mającym siedzibę na terytorium kraju wskazanym w zgłoszeniu identyfikacyjnym, o którym mowa w odrębnych przepisach, w terminie 60 dni licząc od dnia złożenia rozliczenia przez podatnika, z zastrzeżeniem ust. 3.

Różnica podatku podlegająca zwrotowi w kwocie przekraczającej wartość podatku naliczonego związanego z nabyciem towarów i usług, które na podstawie przepisów o podatku dochodowym są zaliczane przez podatnika do środków trwałych oraz wartość niematerialnych i prawnych podlegających amortyzacji, powiększonej o 22% obrotu podatnika opodatkowanego stawkami niższymi, niż określona w art. 41 ust. 1 podlega zwrotowi w terminie 180 dni od dnia złożenia deklaracji podatkowej (art. 87 ust. 3 ustawy).
Zatem, biorąc pod uwagę powyższe, Urząd Skarbowy dokonuje zwrotu podatku na rachunek bankowy w dwóch terminach:
- w terminie 60 dni od dnia złożenia rozliczenia - do wartości kwoty podatku naliczonego od zakupów inwestycyjnych, powiększonej o kwotę odpowiadającą kwocie 22% obrotu opodatkowanego stawkami niższymi od stawki podstawpwej,
- w terminie 180 dni od dnia złożenia rozliczenia - wartość różnicy podatku naliczonego, która będzie wyższa niż kwota obliczona w powyższy sposób.

Ponadto powołany przepis art. 87 przewiduje możliwość skrócenia obu terminów odpowiednio do 25 dni i 60 dni na umotywowany wniosek podatnika złożony wraz z deklaracją podatkową, jeżeli zostaną spełnione warunki określone w ust. 6 art. 87 ww. ustawy.
Reasumując, spółdzielnia ma prawo otrzymać zwrot nadwyżki podatku naliczonego nad należnym w miesiącu, w którym wystąpi dostawa towarów lub usług w terminach wyżej określonych, pod warunkiem złożenia w ustawowym terminie deklaracji VAT-7 z wykazaną do zwrotu kwotą podatku.