Z pisma wnioskodawcy wynika następujący stan faktyczny:
Podatnik po przekroczeniu kwoty zwolnienia podmiotowego w zakresie podatku (obligatoryjna utrata statusu podatnika zwolnionego podmiotowo z uwagi na przekroczoną kwotę sprzedaży w okresie prowadzenia działalności), nie dokonał zgłoszenia rejestracyjnego oraz wystawiał rachunki.
"Gdy zorientowałem się o błędzie natychmiast dokonałem rejestracji VAT-u w Urzędzie Skarbowym (...)."
Wg Strony - "... prawo podatkowe zezwala na anulowanie rachunków uproszczonych wystawionych w miesiącach, których obrót przekroczył sumę wolną od podatku VAT. A następnie umożliwia w to miejsce wystawienie faktury VAT z naliczonym podatkiem od towarów i usług z autentyczną datą wystawienia faktury VAT i wskazaniem miesiąca w którym została wykonana usługa."

Ustosunkowując się do powyższego Naczelnik Urzędu Skarbowego w Wałbrzychu wyjaśnia co następuje:
Szczegółowe regulacje dotyczące zasad wystawiania faktur VAT normują przepisy rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 25 maja 2005 r. w sprawie zwrotu podatku niektórym podatnikom, zaliczkowego zwrotu podatku, zasad wystawiania faktur, sposobu ich przechowywania oraz listy towarów i usług, do których nie mają zastosowania zwolnienia od podatku od towarów i usług (Dz. U. Nr 95, poz. 798).

Stosownie do zapisu § 8 ust. 1 powołanego rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 25 maja 2005 r. - zarejestrowani podatnicy jako podatnicy czynni, posiadający numer identyfikacji podatkowej, wystawiają faktury oznaczone wyrazami "FAKTURA VAT".

Zgodnie z regulacją § 13 ust. 2 cyt. rozporządzenia Ministra Finansów - fakturę wystawia się nie później niż siódmego dnia od dnia wydania towaru lub wykonania usługi (...).
Z pisma Wnioskodawcy wynika, iż w okresie przed dokonaniem rejestracji w zakresie VAT wystawiał on rachunki uproszczone dokumentujące dokonaną sprzedaż.

Zatem czynność sprzedaży została udokumentowana rachunkiem wystawionym w trybie regulacji art. 87 cyt. w osnowie ustawy Ordynacja podatkowa. W świetle tego przepisu - "(...) podatnicy prowadzący działalność gospodarczą obowiązani są na żądanie kupującego lub usługobiorcy wystawić rachunek potwierdzający dokonanie sprzedaży lub wykonanie usługi."

Stosownie do brzmienia § 16 ust. 1 cyt. rozporządzenia Ministra Finansów, w przypadku, gdy po wystawieniu faktury udzielono rabatów (...) podatnik udzielający wystawia fakturę korygującą.
Podobnie, w myśl § 17 ust. 1 cyt. rozporządzenia, fakturę wystawia się, gdy podwyższono cenę po wystawieniu faktury (...).
Powołany wyżej akt wykonawczy do ustawy z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług (Dz. U. Nr 54, poz. 535 ze zm.), nie zawiera regulacji uprawniających podatnika do "skorygowania" rachunków - fakturą VAT.

Z przedstawionego przez Pana stanu faktycznego wynika, że transakcje dokonane po momencie utraty prawa do zwolnienia z VAT zostały udokumentowane rachunkami, bowiem do dnia 07.02.06r. nie dokonał Pan rejestracji jako czynny podatnik podatku VAT.
Zatem forma tych dokumentów w chwili ich wystawienia była właściwa - rachunki. Stąd w ocenie tut. organu podatkowego propozycja anulowania ich i zastąpienia fakturami VAT jest nieuzasadniona.
Powyższe oznacza, iż w opisanym stanie faktycznym, nie może już Pan wystawić faktur VAT do czynności zaszłych, które wcześniej zostały udokumentowane rachunkami wystawionymi w trybie przepisów Ordynacji podatkowej.
Zatem stanowisko Strony w sprawie uznać należy za nieprawidłowe.