Z przedstawionego we wniosku stanu faktycznego wynika, że Uczelnia wypłaca wynagrodzenia osobom pracującym (na podstawie umów o pracę, dzieło i zlecenie) przy przedsięwzięciach finansowanych ze środków otrzymanych bezpośrednio z zagranicy. Pomoc ta pochodzi od instytucji zagranicznych i jest przeznaczona na realizację badań naukowych.

W związku z tak przedstawionym stanem faktycznym Uczelnia stoi na stanowisku iż wynagrodzenia te korzystają ze zwolnienia zawartego w art. 21 ust. 1 pkt 46 ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych.

Naczelnik Drugiego Mazowieckiego Urzędu Skarbowego nie podziela stanowiska Uczelni i wyjaśnia.

Art. 21 ust. 1 pkt 46 ustawy z dnia 26 lipca 1991r. o podatku dochodowym od osób fizycznych (Dz. U. Nr 14 z 2000r. poz. 176 ze zm.) stanowi, iż wolne od podatku dochodowego są dochody otrzymane przez podatnika, jeżeli:

a)pochodzą od rządów państw obcych, organizacji międzynarodowych lub międzynarodowych instytucji finansowych ze środków bezzwrotnej pomocy, w tym ze środków programów ramowych badań, rozwoju technicznego i prezentacji Unii Europejskiej i z programów NATO, przyznanych na podstawie jednostronnej deklaracji lub umów zawartych z tymi państwami, organizacjami lub instytucjami przez Radę Ministrów, właściwego ministra lub agencje rządowe, w tym również w przypadkach, gdy przekazanie tych środków jest dokonywane za pośrednictwem podmiotu upoważnionego do rozdzielania środków bezzwrotnej pomocy oraz

b)podatnik bezpośrednio realizuje cel programu finansowanego z bezzwrotnej pomocy; zwolnienie nie ma zastosowania do dochodów osób fizycznych, którym podatnik bezpośrednio realizujący cel programu zleca - bez względu na rodzaj umowy - wykonanie określonych czynności w związku z realizowanym przez niego programem.

Z przedstawionego przez Uczelnię stanu faktycznego nie wynika ażeby pomoc była przyznana przez jeden z podmiotów wymienionych w lit. a ww. przepisu - określenie “instytucje zagraniczne” wskazane w uzupełnieniu wniosku z dnia 20.11.2006r. nie jest równoznaczne z wskazanymi w tym przepisie podmiotami. W związku z tym nieprawidłowe jest stanowisko Uczelni iż każda pomoc pochodząca od instytucji zagranicznych spełnia przesłanki przedmiotowego zwolnienia.

Reasumując, w przedstawionym przez Uczelnię stanie faktycznym brak jest podstaw do zastosowania zwolnienia zawartego w art. 21 ust. 1 pkt 46 ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych. W związku z powyższym na Uczelni z tytułu dokonywania wypłat wynagrodzenia dla pracowników oraz dla osób świadczących usługi na podstawie umów o dzieło i zlecenie będą ciążyły obowiązki płatnika określone w ustawie o podatku dochodowym od osób fizycznych.